Команду покинули защитники Михаил Рыбалко и Артур Колосков, голкипер Никита Жеймо, а также полузащитники Ибрагим Умаров и Алан Гиоев. Все из перечисленных играли ключевую роль в составе «Балтики» в прошедшем сезоне.
В сезоне 2023 «Балтика-БФУ» финишировала на 8-м месте во второй группе дивизиона Б Второй лиги.